在海豹镇长和企鹅教授的宣传带领下，海底社会认同了“外星人有害论”的观点。小潜艇阿力偶然遇到来地球游玩却和父母走散的小外星人Wugu，通过了解，阿力发现外星人不但不危险，还很友好。为了帮助Wugu找到父母，阿力和朋友贝贝踏上了冒险的旅程……
时尚现代的动漫之都东京，是二次元与三次元交汇的地方。因为误打误撞，女主角误入二次元世界，邂逅深情款款的漫画少年。如同少女漫画中的情节一样，两人一同逛集市、约会，度过许多欢乐美好的时光。渐渐地，盖天天开始适应在二次元世界的生活，发现即使是留在二次元里也没什么不好。然而，通往三次元的钥匙却在这个适合失而复得。
科研潜艇“逗号”，是科幻小说《地心游记》的铁杆粉丝。为研究海底神秘物质, 跟着叔叔地质学家 “铁石号”深潜马里亚纳海沟，意外被卷入洞穴迷宫来到巨大未知世界并发现远古生物，开启了超乎想象的海底地心探险。
本片采用朴素而又现实的表现手法，一个故事是以当下80后的现实爱情故事为背景，讲述了卫梦与肖鸣宇高中时因误会错失情缘，一直单身。同学聚会上两人再次相遇，重燃爱火，却因种种试探，使这段情缘前途未卜。另一个故事则是90后女孩沙立夏追寻音乐梦想的故事背景，独特的拍摄角度展现了高考失意成了父母阻止她音乐梦的导火索，面临父亲的反对，沙立夏毅然决然鼓起勇气坚持梦想，最终赢得了父亲的支持。