故事讲述了青天神域的医圣派的掌门秦笑天，因为救了被各派追杀的第一真人玄火而得罪了五大派，一向清高霸道的秦笑天，因为不愿交出玄火真人而被迫杀了三千高手，后被追杀到青木崖，用尽了所有得真气，被五百顶级高手和五大掌门合力杀死；重生到地球，但是重生后他发现自己天生体内日轮被毁，无法运气，只得借助重生之身在都市中过新的生活。
他身背血海深仇，在市井忍辱偷生，机缘巧合之下，获得了一代医圣的衣钵传承。一边悬壶济世，一边辣手复仇。胸怀仁心，妙手无双，且看他如何带领三千华夏龙卫扫荡天下。
剧集以医圣张仲景生平为背景，加以艺术创作，讲述了张仲景家族没落后投奔悬济堂潜心学医，历经磨难终成一代宗师的故事。